R'MES is a tool to find motifs with a significantly unexpected frequency in biological sequences
The main question R'MES addresses is "does this motif occur in that biological sequence with an expected frequency?" In other words, can we observe it so many times, or so few times, just by chance? Usually, when the answ er is no, such a motif is a candidate to have a particular biological meaning; only a candidate: statistical significance is not equivalent to biological significance.
Mots clés
Lien vers l'élément du SI MIA
https://mulcyber.toulouse.inra.fr/projects/rmes/ Informations générales
Statut
Accessible en production Partenaire externe
Mark Hoebeke (CNRS) Guide de l'utilisateur
R'MES : Finding Exceptional Motifs in Sequences Tutoriel
R'MES: Statistical Method Manuel de référence
rmes3.1.0.userGuide.pdf Suivi
Non-maintenu Informations spécifiques
Langage(s) de développement
Langage(s) d'interface
N° de version courante
V3.1.0 Date de la version courante
OS supporté
Type de licence
Etat
Développement arrêté Porteur(s)
Unité
MaIAGE Equipe
StatInfOmics Auteur(s)
Schbath Sophie
Contact
sophie.schbath@inra.fr
Publication de référence
Informations complémentaires
Langages C et C++